V poslední sezóně působil mladý hokejista v týmu úřadujícího slovenského mistra Slovanu Bratislava, za jehož barvy bojoval v patnácti zápasech, ve kterých nasbíral šest bodů za tři góly a tři asistence. V ročníku 06/07 nahlédl i do slovenské první ligy, kde odehrál za HK Ružinov 99 Bratislava dva zápasy. Více duelů mu nedovolilo odehrát zranění. V metropoli našich východních sousedů strávil Prokop většinu své nedlouhé kariéry.
V letech 99 - 03 nastupoval Juraj za Slovan v extralize dorostu, do vyšší soutěže - extraligy juniorů - naskočil poprvé už v sezóně 01/02, na delší dobu se v ní usídlil o rok později. Prokopovy kroky vedly dále do moravského Vsetína. Za tamní juniorku hrál v ročníku 03/04, na devatenáct zápasů se probojoval i do A týmu Valachů, díky nimž nakoukl do české nejvyšší soutěže. Rok nato se Prokop ukázal i v severoamerické WHL, kde v šesti utkáních nastoupil v dresu Medicine Hat Tigers, v nichž posbíral pět bodů za gól a čtyři nahrávky.
Po návratu na Slovensko se představoval opět v týmu bratislavského Slovanu. Většinu sezóny 04/05 odehrál v jeho juniorce. Už tehdy začal hrát i slovenskou extraligu, kde zůstal s přestávkami, které vyplnilo několik zápasů v prvoligové Trnavě, až do minulé sezóny.
Prokop se může pochlubit i sedmi odehranými duely v reprezentaci. Na mistrovství světa osmnáctiletých v roce 2003 se zapsal do historie turnaje třemi body za tři asistence.
Kometa bude prvním Prokopovým prvoligovým angažmá v České republice. Brněnský trenér Rostislav Čada o mladém hráči řekl: "Juraj je typický tvořivý centr s citem pro hru, a navíc je pravák, kterých moc nemáme."
Statistiky
Sezóna Klub Z G A B TM 1999-00 HC Slovan Bratislava (SR, ELH dor.) 4 1 1 2 0 2000-01 HC Slovan Bratislava (SR, ELH dor.) 29 11 21 32 8 2001-02 HC Slovan Bratislava (SR, ELH dor.) 13 8 6 14 31 HC Slovan Bratislava (SR, ELH dor.,p-o) 8 3 2 5 16 HC Slovan Bratislava (SR, ELH jun.) 2 0 0 0 2 2002-03 HC Slovan Bratislava (SR, ELH dor.) 13 5 11 16 4 HC Slovan Bratislava (SR, ELH dor.,p-o 6 1 6 7 27 HC Slovan Bratislava (SR, ELH jun.) 31 10 13 23 12 2003-04 HC Slovan Bratislava (SR, ELH jun.) 5 4 3 7 4 HC Vsetín (ELH, jun.) 36 16 19 35 12 HC Vsetín (ELH, jun., p-o) 7 2 1 3 0 HC Vsetín (ELH) 19 1 0 1 6 2004-05 Medicine Hat Tigers (WHL) 6 1 4 5 0 HC Slovan Bratislava (SR, ELH jun.) 29 9 20 29 20 HC Slovan Bratislava (SR, ELH jun.,p-o) 3 2 0 2 2 HC Slovan Bratislava (SR, ELH) 5 0 0 0 0 HC Trnava (SR, 1.liga) 7 2 4 6 0 2005-06 HC Slovan Bratislava (SR, ELH) 33 0 2 2 0 HC Slovan Bratislava (SR, ELH,p-o) 1 1 0 1 0 HC Slovan Bratislava (SuperSix) 2 0 0 0 0 HC Trnava 7 4 1 5 4 2006-07 HC Slovan Bratislava (SR, ELH) 15 3 3 6 0 HK Ruzinov 99 Bratislava (SR, 1.liga) 2 0 1 1 0 Reprezentace: 2003 Slovensko "18" 7 0 3 3 2